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1 Introduction

1.1 Vocabulaire

nécessité de bien connaître le vocabulaire utilisé pour caractériser la morphologie des champignons:

* thalle septé

* thalle coénocytique ou siphoné

* thalle dissocié et pseodomycélium

* spores asexuées

* endospores (Mucorales)

* spores externes = Conidies (aleuriospores, arthro-spores, blastospores, sympodulospores, radulospores, blastoarthro-spores, porospores, phialospores, annelospores...). La spores porte le nom de l'organe ou de la fructification qui lui a donné naissance, ou bien encore en raison d'une caractéristique qui lui est associée.

* spores sexuées

* Basidiospores

* Ascospores

* Zygospores

1.2 Éléments de classification

Spores immobiles

* reproduction sexuée par Zygospore: Zygomycotina

* reproduction sexuée par Ascospore: Ascomycotina

* reproduction sexuée par Basidiospores: Basidiomycotina

* pas de reproduction sexué connue: Deuteromycotina (Adelomycetes ou Fungi imperfecti). Ces termes sont obsolètes et ne doivent plus être utilisés

2 Les mycoses

2.1 Définition

Les mycoses sont des infections provoquées par des champignons microscopiques. 90 espèces sont pathogènes ou potentiellement pathogène pour l’homme et les animaux.

2.2 Habitat

2.3 Notion d'endogène et d'exogène

3 Introduction

3.1 Réponse de l'hôte

Caractères distinctifs des mycoses:

*Allure chronique ou sub-aiguë quelquefois aiguë

*Absence de modifications de la formule leucocytaire (sauf septicémie)

*Absence de fièvre (sauf septicémie

*Résistance aux traitements antibactériens

*Forme de la lésion

Localisation des champignons:

*Peau: dermatophytes

*SNC: Cryptococcus

*Muqueuses: Candida albicans

*SRH (=SCMN): Histoplasma, Coccidioides

4 Principe du diagnostic mycologique

4.1 Clinique des mycoses superficielles

	Peau glabre
	Cheveux et poils
	Ongles
	Muqueuses: buccale, oculaire, génitale, bronchique, digestive

4.2 Clinique des mycoses profondes

	SRH: Histoplasma, Coccidioides...
	SNC: Cryptococcus...
	SC: Chromomycoses, mycétomes

4.3 Examens microscopiques

	ED: LCR, urines, selles...
	Eclaircissements: squames, cheveux poils, ongles
	Colorations: Gram, Zielh, BM, Giemsa, encre de chine,
	PAS (Hotchkiss-McManus), Gomori-Grocott

4.4 Milieux de Cultures et ensemencements

	Plusieurs tubes
	Milieux de Sabouraud, Géloses nutritives, Milieu de Lowenstein...
	Technique en plusieurs points
	Températures d'incubation

4.5 Identifications

	Milieux spéciaux: Malt, Czapek, PC, PCB, PDA...
	Auxanogramme et Zymogramme des substances carbonées
	Aspects macroscopiques des cultures
	Examens des morphologies microscopiques
	Biologie Moléculaire (rARN)
	ITS2 (Internal Transcrobed Spacer)
	26/28S; 18S; 5,8/5S